Krav
PATENTKRAV1. Immunsuppressivt medikament for anvendelse i behandlingen av en tilstand hos et individ med behov for immunsuppressiv medikamentterapi,hvori individet har en redusert risiko for progressiv multifokal leukoencefalopati (PML) som følge av en infeksjon i hjernen av John Cunningham-virus (JCV),hvori individets reduserte risiko skyldes fraværet av en genomisk variasjon valgt fra gruppen som består av: chr9:137779251, G>A og chr1:160769595, AG>A,hvori kromosomposisjonen til den genomiske variasjonen er definert med hensyn til UCSC hg19.2. Immunsuppressivt medikament for anvendelse ifølge krav 1, hvori tilstanden er en kreft, en organtransplantasjon eller en autoimmun sykdom, eventuelt hvori:(i) den autoimmune sykdommen velges fra gruppen som består av Addisons sykdom, anti-NMDA-reseptorencefalitt, antisyntetasesyndrom, aplastisk anemi, autoimmun anemi, autoimmun hemolytisk anemi, autoimmun pankreatitt, Behcets sykdom, bulløse hudsykdommer, cøliaki - sprue (glutensensitiv enteropati), kronisk utmattelsessyndrom, kronisk inflammatorisk demyeliniserende polynevropati, kronisk lymfatisk leukemi, Crohns sykdom, dermatomyositt, Devics sykdom, erytroblastopeni, Evans syndrom, fokal segmentell glomerulosklerose, granulomatose med polyangiitt, Graves sykdom, Graves oftalmopati, Guillain-Barre syndrom, Hashimotos tyreoiditt, idiopatisk trombocytopenisk purpura (ITP), IgA-nefropati, IgA-medierte autoimmune sykdommer, IgG4-relatert sykdom, inflammatorisk tarmsykdom, juvenil idiopatisk artritt, multippel sklerose, myasthenia gravis, myelom, non-Hodgkins lymfom, opsoklonusmyoklonussyndrom (OMS), pemfigoid, pemfigus, pemfigus vulgaris, pernisiøs anemi, polymyositt, psoriasis, ren rødcelleaplasi, reaktiv artritt, revmatoid artritt, sarkoidose, sklerodermi, Sjögrens syndrom, systemisk lupus erythematosus, trombocytopenisk purpura, trombotisk trombocytopenisk purpura, diabetes type I, ulcerøs kolitt, vaskulitt, vitiligo og kombinasjoner derav;(ii) den autoimmune sykdommen er multippel sklerose eller Crohns sykdom; eller (iii) den autoimmune sykdommen er en residiverende form for multippel sklerose.3. Immunsuppressivt medikament for anvendelse ifølge et hvilket som helst foregående krav, hvori(i) det immunsuppressive medikamentet omfatter abatacept, abrilumab, acalabrutinib, adalimumab, adrenokortikotropisk hormon, agatolimodnatrium, aldesleukin, alefacept, alemtuzumab, alisertib, alvespimycinhydroklorid, alvocidib, ambrisentan, aminocamptotecin, amiselimod, anakinra, andecaliksimab, andrografolider, anifrolumab, antitymocytt Ig, apatinib, apelisib, asparaginase, atacicept, atezolizumab, avelumab, azacitidin, azatioprin, bafetinib, baminercept, baricitinib, basiliksimab, becatecarin, begelomab, belatacept, belimumab, bemcentinib, bendamustin, betalutin med lilotomab, bevacizumab, bimekizumab, binimetinib, bleomycin, blinatumomab, BNZ-1, bortezomib, brentuksimab vedotin, bryostatin 1, bucillamin, buparlisib, busulfan, canakinumab, capecitabin, karboplatin, karfilzomib, karmustin, cediranib maleat, cemiplimab, ceralifimod, cerdulatinib, certolizumab, cetuksimab, chidamid, klorambucil, cilengitid, cirmtuzumab, cisplatin, kladribin, clazakizumab, klemastin, clioquinol, kortikosteroider, syklofosfamid, syklosporin, cytarabin, cytotoksisk kjemoterapi, daklizumab, dalfampridin, daprolizumab pegol, daratumumab, dasatinib, defaktinib, defibrotid, denosumab, deksametason, diacerein, dimetylfumarat, dinasiklib, diroksimelfumarat, doksorubicin, durvalumab, duvelisib, duvortuksizumab, ekulizumab, efalizumab, eftilagimod alfa, en nevropeptidkombinasjon av metenkefalin og tridekaktid, elezanumab, elotuzumab, enkorafenib, entinostat, entospletinib, enzastaurin, epakadostat, epirubicin, epratuzumab, eritoran tetranatrium, etanercept, etoposid, etrolizumab, everolimus, evobrutinib, filgotinib, fingolimod, firategrast, fludarabin, fluorouracil, fontolizumab, forodesinhydroklorid, fostamatinib, galunisertib, ganetespib, ganitumab, gemcitabin, gemtuzumab ozogamicin, gerilimzumab, glasdegib, glassia, glatirameracetat, glembatumumab vedotin, glesatinib, golimumab, guadecitabin, hydrokortison, hydroksyklorquinsulfat, hydroksyurea, ibritumomab tiuksetan, ibrutinib, ibudilast, idarubicin, idebenon, idelalisib, ifosfamid, iguratimod, imatinib, imekson, infliksimab, inotuzumab ozogamicin, interferon alfa-2, interferon beta-1a, interferon beta-1b, interferon gamma-1, ipilimumab, irofulven, isatuksimab, ispinesib, itacitinib, iksazomib, lapatinib, laquinimod, laromustin, Id-aminopterin, leflunomid, lenalidomid, lenvatinib, letrozol, levamisol, levokabastin, liponsyre, lirilumab, lonafamib, lumiliksimab, masitinib, mavrilimumab, melfalan, merkaptopurin, metotreksat, metoxsalen, metylprednison, milatuzumab, mitoksantron, mizoribin, mocetinostat, monalizumab, mosunetuzumab, motesanib difosfat, moxetumomab pasudotox, muromonab-CD3, mykofenolatmofetil, mykofenolsyre, namilumab, natalizumab, navitoklaks, neihulizumab, nerispirdin, neurovax, niraparib, nivolumab, obatoklaxmesylat, obinutuzumab, oblimersennatrium, okrelizumab, ofatumumab, olokizumab, opicinumab, oprelvekin, osimertinib, oteliksizumab, oksaliplatin, oxkarbazepin, ozanimod, paklitaksel, pakritinib, palifermin, panobinostat, pazopanib, peficitinib, pegfilgrastim, peginterferon beta-1a, pegsunercept (peg stnf-ri), pembrolizumab, pemetreksed, penklomedin, pentostatin, perifosin, pevonedistat, peksidartinib, pikoplatin, pidilizumab, pivanex, piksantron, pleneva, plovameracetat, polatuzumab vedotin, pomalidomid, ponatinib, ponesimod, prednison/prednisolon, pyroksamid, ravulizimab-cwvz, rekombinant il-12, relatlimab, rhigf-1, rhigm22, rigosertib, rilonacept, rituksimab, ruksolitinib, sarilumab, secukinumab, selumetinib, simvastatin, sintilimab, siplizumab, siponimod, sirolimus, sirukumab, sitravatinib, sonidegib, sorafenib, sotrastaurinacetat, sunitinib, sunfenon epigallokatekin-gallat, tabalumab, takrolimus, talabostatmesylat, talakotuzumab, tanespimycin, tegafur/gimeracil/oteracil, temozolomid, temsirolimus, tenalisib, terameprokol, teriflunomid, talidomid, tiarabin, tiotepa, tipifarnib, tirabrutinib, tislelizumab, tivozanib, tocilizumab, tofacitinib, tregalizumab, tremelimumab, treosulfan, ublituksimab, umbralisib, upadacitinib, urelumab, ustekinumab, varlilumab, vatelizumab, vedolizumab, veliparib, veltuzumab, venetoclax, vinblastin, vinkristin, vinorelbinditartrat, visilizumab, vismodegib, vistusertib, vorikonazol, vorinostat, vosaroksin, ziv-aflibercept, 6,8-bis(benzyltio)oktansyre, eller en hvilken som helst kombinasjon derav;(ii) det immunsuppressive medikamentet omfatter natalizumab, interferon beta-1a, interferon beta-1b, glatirameracetat, peginterferon beta-1a, teriflunomid, fingolimod, dimetylfumarat, alemtuzumab, mitoksantron, rituksimab, daklizumab, okrelizumab, diroksimelfumarat eller siponimod, eller en hvilken som helst kombinasjon derav; eller (iii) det immunsuppressive medikamentet omfatter adalimumab, alemtuzumab, alemtuzumab, azatioprin, belimumab, bevacizumab, bortezomib, ekulizumab, leflunomid, brentuksimab vedotin, cetuksimab, syklofosfamid, dimetylfumarat, efalizumab, fingolimod, fludarabin, fumarsyre, imatinib, infliksimab, metotreksat, mykofenolatmofetil, natalizumab, daklizumab, rituksimab, vedolizumab, ruksolitinib eller okrelizumab.4. Immunsuppressivt medikament for anvendelse ifølge et hvilket som helst foregående krav, hvori det immunsuppressive medikamentet omfatter natalizumab, eventuelt hvori:(i) natalizumab administreres via intravenøs infusjon;(ii) ca.100 mg til ca.500 mg av natalizumab administreres;(iii) ca.100 mg til ca.500 mg av natalizumab administreres i fire uker;(iv) ca.100 mg til ca.500 mg av natalizumab administreres via intravenøs infusjon i fire uker;(v) ca.100 mg til ca.500 mg av natalizumab administreres via intravenøs infusjon i seks uker;(vi) ca.100 mg til ca.500 mg av natalizumab administreres via intravenøs infusjon i åtte uker; eller (vii) natalizumab administreres subkutant.5. Immunsuppressivt medikament for anvendelse ifølge et hvilket som helst foregående krav, hvori de genomiske sekvensene til individet bestemmes ved en genetisk test som omfatter deteksjon av den genomiske variasjonen i en polynukleinsyreprøve oppnådd fra individet, eventuelt hvori:(i) den genetiske testen omfatter å analysere et helt genom eller hele eksomet til individet; (ii) den genetiske testen omfatter å analysere nukleinsyreinformasjon som allerede er oppnådd for et helt genom eller et helt eksom til individet;(iii) den genetiske testen omfatter å analysere nukleinsyreinformasjon som allerede er oppnådd for et helt genom eller et helt eksom til individet, hvori nukleinsyreinformasjonen oppnås fra en in silico-analyse;(iv) individet er et menneske; eller(v) polynukleinsyreprøven omfatter en polynukleinsyre fra blod, spytt, urin, serum, tårer, hud, vev eller hår fra individet.6. Immunsuppressivt medikament for anvendelse ifølge krav 5, hvori den genetiske testen omfatter mikromatriseanalyse, PCR, sekvensering, nukleinsyrehybridisering eller en hvilken som helst kombinasjon derav, eventuelt hvori:(i) mikromatriseanalysen velges fra gruppen som består av en komparativ genomisk hybridisering (CGH)-matriseanalyse og en SNP-matriseanalyse, eller(ii) sekvenseringen velges fra gruppen som består av massiv parallell signatursekvensering (MPSS), polonisekvensering, 454-pyrosekvensering, Illuminasekvensering, Illumina (Solexa)-sekvensering ved anvendelse av 10X Genomicsbibliotekpreparat, SOLiD-sekvensering, ionhalvledersekvensering, DNA-nanokulesekvensering, sekvensering av enkeltmolekyler i heliskop, sekvensering av enkeltmolekyler i sanntid (SMRT), RNAP-sekvensering, Nanopore-DNA-sekvensering, sekvensering ved hybridisering og mikrofluidisk Sanger-sekvensering.7. Immunsuppressivt medikament for anvendelse ifølge et hvilket som helst foregående krav, hvori den genomiske variasjonen er en heterozygot SNV eller en homozygot SNV.8. Immunsuppressivt medikament for anvendelse ifølge et hvilket som helst foregående krav, hvori: (a) det immunsuppressive medikamentet for anvendelse videre omfatter et middel som reduserer en JCV-virusmengde i individet; eller(b) det immunsuppressive medikamentet er for administrering før, eller i forbindelse med et middel som reduserer en virusmengde i individet,eventuelt hvori:(i) det immunsuppressive medikamentet administreres etter at virusmengden er redusert; eller(ii) midlet som reduserer virusmengden er et middel som retter seg mot JCV.9. Fremgangsmåte for å redusere risikoen for at et individ utvikler progressiv multifokal leukoencefalopati (PML), omfattende(a) å teste et individ for tilstedeværelsen av en genomisk variasjon valgt fra gruppen som består av: chr9:137779251, G>A og chr1:160769595, AG>A, hvori kromosomposisjonen til den genomiske variasjonen er definert med hensyn til UCSC hg19;(b) å bestemme at individet har den genomiske variasjonen, og(c) å råde mot å administrere immunsuppressivt medikament til individet som ble bestemt å ha den genomiske variasjonen, hvori det immunsuppressive medikamentet omfatter natalizumab, interferon beta-1a, interferon beta-1b, glatirameracetat, peginterferon beta-1a, teriflunomid, fingolimod, dimetylfumarat, alemtuzumab, mitoksantron, rituksimab, daklizumab, okrelizumab, diroksimelfumarat eller siponimod,eventuelt hvori:(i) rådgivningen omfatter å gi råd om at administrering av immunsuppressivt medikament er kontraindisert;(ii) rådgivningen omfatter å gi råd om at administrering av immunsuppressivt medikament øker risikoen for at individet utvikler progressiv multifokal leukoencefalopati (PML);(iii) rådgivningen omfatter å gi råd om at administrering av immunsuppressivt medikament er en faktor som øker risikoen for at individet utvikler progressiv multifokal leukoencefalopati (PML); eller(iv) hvori det immunsuppressive medikamentet omfatter natalizumab.10. Fremgangsmåte for å identifisere et individ som har en risiko for å utvikle progressiv multifokal leukoencefalopati (PML) omfattende:(a) å analysere en polynukleinsyreprøve fra individet for en genomisk variasjon valgt fra en gruppe som består av: chr9:137779251, G>A og chr1:160769595, AG>A, hvori kromosomposisjonen til den genomiske variasjonen er definert med hensyn til UCSC hg19;(b) å etablere tilstedeværelsen av den genetiske variasjonen i polynukleinsyreprøven; og (c) å identifisere individet som har høy risiko for å utvikle PML;hvori individet er immunsvekket,eventuelt hvori individet har HIV, har mottatt en organtransplantasjon, eller lider av en tilstand valgt fra en kreftform, en hematologisk malignitet, en autoimmun sykdom eller idiopatisk CD4+ lymfocytopeni (ICL).11. Det immunsuppressive medikamentet for anvendelse ifølge et hvilket som helst av kravene 1 til 8, eller fremgangsmåten ifølge krav 9 eller 10, videre omfattende å analysere for en tilstedeværelse av JCV i en biologisk prøve fra individet, hvori analysen for en tilstedeværelse av JCV omfatter en JCV-antistofftest eller en CSF IgM-oligoklonal båndtest,eventuelt hvori:analysen for en tilstedeværelse av JCV omfatter testing av individet med JCV-antistofftesten,hvori JCV-antistofftesten detekterer eller ikke detekterer en tilstedeværelse av JCV, eller JCV-antistofftesten omfatter å bringe en JCV-deteksjonsreagens i kontakt med en biologisk prøve fra individet, eventuelt hvori JCV-deteksjonsreagensen velges fra gruppen som består av et anti-JCV-antistoff, en JCV-spesifikk primer og kombinasjoner derav.