Viktig informasjon i saken hentes i sanntid direkte fra EPO sitt register (European Patent Register), slik at du enkelt og raskt får oversikt i saken.
Beskrivelse Verdi
Saken / databasen er sist oppdatert info  
Tittel SIMULTANEOUS SPATIO-TEMPORAL MEASUREMENT OF GENE EXPRESSION AND CELLULAR ACTIVITY
Status
Hovedstatus
Detaljstatus
I kraft info EP patent gjort gjeldende i Norge EP patent besluttet gjeldende i Norge
Patentnummer NO/EP4153775
Europeisk (EP) publiserings nummer EP4153775
EP levert
EP søknadsnummer 21733274.1
EP meddelt
Prioritet 2020.05.22, US 202063029121 P, .... se mer/flere nedenfor
Sakstype Europeisk
Løpedag
Utløpsdato
Allment tilgjengelig
Validert i Norge
Innehaver 10X Genomics, Inc. (US)
Oppfinner UYTINGCO, Cedric (US) .... se mer/flere nedenfor
Fullmektig RWS (GB)
Lenke til European patent Register Informasjon i saken, dokumenter og patentfamilie
Patentfamilie Se i Espacenet

EPO translation logo


Se forsidefigur og sammendrag i Espacenet

T3

Beskrivelse

Krav

Patentkrav1. Fremgangsmåte for å identifisere lokasjon og/eller forekomst av en analytt i en biologisk prøve, fremgangsmåten omfattende:(a) å registrere en cellulær aktivitet og/eller en intracellulær genuttrykking av en nukleinsyre i den biologiske prøven, hvori den biologiske prøven lokaliseres i et perfusjonskammer av et mangfold av perfusjonskamre, hvori perfusjonskammeret omfatter et substrat og en pakning;(b) å bringe den biologiske prøven i kontakt med substratet omfattende et mangfold av fangstprober, hvori en fangstprobe av mangfoldet av fangstprobene omfatter (i) en romlig strekkode og (ii) et fangstdomene som binder spesifikt til en sekvens til stede i analytten; (c) å forlenge fangstproben ved å anvende analytten som er spesifikt bundet til fangstdomenet som en mal, for derved å generere en forlenget fangstprobe;(d) å amplifisere den forlengede fangstproben for å fremstille et mangfold av forlengede fangstprober; og(e) å bestemme (i) hele sekvensen til den romlige strekkoden, eller et komplement derav, og (ii) hele eller en del av sekvensen til analytten, eller et komplement derav, og å anvende de bestemte sekvensene til (i) og (ii) til å identifisere lokasjonen og/eller forekomsten av analytten i den biologiske prøven;hvori fremgangsmåten videre omfatter:å montere pakningen på substratet,hvori substratet omfatter et mangfold av substratregioner, hvori en substratregion av mangfoldet av substratregioner omfatter fangstproben omfattende (i) den romlige strekkoden og (ii) fangstdomenet som binder spesifikt til sekvensen til stede i analytten, hvori pakningen omfatter henholdsvis (i) et mangfold av åpninger som tilsvarer mangfoldet av substratregioner, henholdsvis (ii) et mangfold av inngangskanaler som er lett koblet til mangfoldet av åpninger og henholdsvis (iii) et mangfold av utgangskanaler som er lett koblet til mangfoldet av åpninger, oghvori mangfoldet av åpninger i pakningen innrettes med mangfoldet av substratregioner av substratet når pakningen er montert på substratet; og å montere et deksel på pakningen for å definere et mangfold av perfusjonskamre,hvori dekselet inkluderer et innløp og et utløp, innløpet er lett koblet til mangfoldet av inngangskanaler når dekselet er montert på pakningen, utløpet er lett koblet til mangfoldet av utgangskanaler når dekselet er montert på pakningen, oghvori mangfoldet av perfusjonskamre er definert av (i) mangfoldet av substratregioner av substratet, (ii) mangfoldet av åpninger i pakningen som er montert på substratet, og (iii) dekselet som er montert på pakningen. 2. Fremgangsmåten ifølge krav 1, hvori monteringen av pakningen på substratet og monteringen av dekselet på pakningen for å definere mangfoldet av perfusjonskamre forekommer før registreringen av den cellulære aktiviteten eller registreringen av det intracellulære genuttrykket, og/ellerhvori fremgangsmåten videre omfatter å perfusere en testforbindelse gjennom perfusjonskammeret før registreringstrinnet eller i det vesentlige samtidig som omkodingstrinnet, fortrinnsvis hvori testforbindelsen er et legemiddel.3. Fremgangsmåten ifølge krav 1 eller 2, hvori substratet er et dekkglass omfattende plast, metall eller glass; og/ellerhvori fangstproben festes til substratet via en koblingsgruppe, eventuelt hvori koblingsgruppen er en amidgruppe; og/ellerhvori substratet omfatter en referansemarkør.4. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1‒3, videre omfattende å dyrke den biologiske prøven i perfusjonskammeret før registreringstrinnet.5. Fremgangsmåten ifølge krav 4, hvori den biologiske prøven dyrkes i et kulturmedium for å opprettholde dens levedyktighet, hvori kulturmediet erstattes ved et passende intervall manuelt eller automatisk, og/eller hvori den biologiske prøven dyrkes statisk;eventuelt hvori kulturmediet suppleres med oksygen og/eller hvori kulturmediet omfatter en blokkerende reagens eller hvori den biologiske prøven behandles med blokkeringsreagensen.6. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1‒5, hvori den cellulære aktiviteten omfatter proteinaktivitet, fosforyleringsaktivitet, G-proteinkoplet reseptorrelatert aktivitet, ionekanalaktivitet, ligandreseptorbindingsaktivitet, nevral aktivitet, proteinsyntese, proteinuttrykking og lokalisering, forbigående optisk aktivitet, celle-til-celle interaksjoner, cellulær morfologi eller kombinasjoner derav; og/eller hvori registreringen omfatter optisk registrering, eventuelt hvori den optiske registreringen omfatter å bringe den biologiske prøven i kontakt med et kjemisk fargestoff, hvori det kjemiske fargestoffet er et spenningsfølsomt fargestoff, et pH-følsomt fargestoff, et temperaturfølsomt fargestoff, et lysfølsomt fargestoff, et oksygenfølsomt fargestoff, eller et metallfølsomt fargestoff, fortrinnsvis hvori det metallfølsomme fargestoffet er et kalsiumfølsomt fargestoff, ellerhvori den optiske registreringen omfatter merking av den biologiske prøven med en indikator, hvori indikatoren er en genetisk kodet indikator, hvori den genetisk kodede indikatoren er en genetisk kodet nevral aktivitetsindikator, en genetisk kodet spenningsindikator (GEVI) eller en genetisk kodet kalsiumindikator (GECI eller GCaMP), og eventuelthvori det kjemiske fargestoffet eller indikatoren videre omfatter en fluorofor; og/eller hvori den optiske registreringen oppnås ved in situ-hybridisering eller fluorescensresonansenergioverføring (FRET); og/ellerhvori den optiske registreringen omfatter hybridisering av et mangfold av optisk merkede prober til (a) et protein, et lipid, en nukleinsyre eller en kombinasjon derav assosiert med den cellulære aktiviteten; eller (b) nukleinsyren assosiert med den intracellulære genuttrykkingen, eventuelt hvori en optisk merket probe av mangfoldet er en peptidnukleinsyre (PNA)-probe merket med en fluorofor, fortrinnsvis hvori PNA-proben er minst 10 nukleinsyrer, minst 15 nukleinsyrer, minst 20 nukleinsyrer, minst 25 nukleinsyrer, minst 30 nukleinsyrer eller lenger; og/ellerhvori den optiske registreringen utføres ved anvendelse av fluorescerende tidsforløpsmikroskopi.7. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1‒6, hvori den biologiske prøven er en vevsprøve, hvori vevsprøven er en levende vevsdel, en organoid prøve eller en sfæroid kulturprøve; eventuelthvori organoidprøven omfatter normale organoider og/eller kreftorganoider, og/eller hvori organoidprøven omfatter intestinale organoider, leverorganoider, pulmonale organoider og/eller nevrale organoider; og/ellerhvori den organoide prøven stammer fra et sykdomspåvirket vev, et normalt vev, en sykdomspåvirket celle, en normal celle, en differensiert celle og/eller stamceller, eventuelt hvori det sykdomspåvirkede vevet er et kreftvev,eventuelt hvori den sykdomspåvirkede cellen er en kreftcelle,eventuelt hvori den differensierte cellen er en somatisk celle,eventuelt hvori stamcellen velges fra en embryonal stamcelle, en indusert pluripotent stamcelle eller en somatisk stamcelle.8. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1‒6, hvori den biologiske prøven er en cellekulturprøve, eventuelt hvori cellekulturprøven er en primær cellekulturprøve omfattende individuelle celler som isoleres fra et friskt vev.9. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1‒8, hvori fangstdomenet til fangstproben blokkeres av en blokkerende probe, fortrinnsvis før kontakttrinnet. 10. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1‒9, hvori den biologiske prøven omfatter et mangfold av levende celler, og de levende cellene farges med immunfluorescens før registreringstrinnet; og/ellerhvori den biologiske prøven farges ved anvendelse av et detekterbart merke, hvori det detekterbare merket er Can-Grunwald, Giemsa, hematoksylin og eosin (H&E), Jenner's, Leishman, Massons trikrom, Papanicolaou, Romanowsky, sølv, Sudan, Wright's og/eller Periodic Acid Schiff (PAS); og/ellerhvori den biologiske prøven avbildes, eventuelt hvori den biologiske prøven avbildes ved anvendelse av lysfeltavbildning; og/ellerhvori den biologiske prøven permeabiliseres med et permeabiliseringsmiddel valgt fra et organisk løsningsmiddel, et tverrbindingsmiddel, en detergent og et enzym, eller en kombinasjon derav, fortrinnsvis etter registreringstrinnet; og/ellerhvori den biologiske prøven fikseres med etanol, metanol, aceton, formaldehyd, paraformaldehyd-Triton, glutaraldehyd, eller kombinasjoner derav, eventuelt hvori formaldehydet er 2 % formaldehyd; fortrinnsvis etter å ha vært brakt i kontakt med den biologiske prøven med substratet, eller etter dyrking av den biologiske prøven på substratet.11. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1‒10, hvori forlengelsestrinnet omfatter å forlenge fangstproben ved 3'-enden; og/ellerhvori forlengelsestrinnet benytter en revers transkriptase; og/eller hvori forlengelsestrinnet benytter fluorescensmerkede nukleotider.12. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1‒11, hvori den biologiske prøven fjernes etter amplifiseringstrinnet; eventuelt hvori den biologiske prøven fjernes enzymatisk etter amplifiseringstrinnet.13. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1‒12, hvori amplifiseringstrinnet omfatter amplifisering av (i) hele eller en del av sekvensen til analytten bundet til fangstdomenet, eller et komplement derav, og (ii) hele sekvensen til den romlige strekkoden, eller et komplement derav; eventuelthvori amplifiseringstrinnet omfatter rullende sirkelamplifisering og/ellerhvori amplifiseringstrinnet benytter en DNA-polymerase, et mangfold av primere og et mangfold av nukleotider.14. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1‒13, hvori bestemmelsestrinnet omfatter sekvensering; eventuelt hvori bestemmelsestrinnet omfatter sekvensering av (i) hele sekvensen til den romlige strekkoden eller komplementet derav, og (ii) hele eller en del av sekvensen til analytten, og/ellerhvori sekvenseringstrinnet omfatter in situ-sekvensering, Sangersekvenseringsfremgangsmåter, neste generasjons-sekvenseringsfremgangsmåter og nanoporesekvensering.15. Fremgangsmåte for å bestemme lokasjon og/eller forekomst av en analytt i et levende vev eller celleprøve, fremgangsmåten omfattende:(a) å tilveiebringe et mangfold av perfusjonskamre, hvori et perfusjonskammer av mangfoldet av perfusjonskamre omfatter et substrat, en pakning montert på substratet, og et deksel montert på pakningen, hvori det levende vevet eller celleprøven er lokalisert i perfusjonskammeret av mangfoldet av perfusjonskamre, hvori(1) substratet omfatter et mangfold av substratregioner, hvori en substratregion av mangfoldet av substratregioner omfatter et mangfold av fangstprober, hvori en fangstprobe av mangfoldet av fangstprober omfatter (i) en romlig strekkode og (ii) et fangstdomene som binder spesifikt til en sekvens til stede i analytten;(2) pakningen omfatter henholdsvis (i) et mangfold av åpninger som tilsvarer mangfoldet av substratregioner, henholdsvis (ii) et mangfold av inngangskanaler som er lett koblet til mangfoldet av åpninger, og henholdsvis (iii) et mangfold av utgangskanaler som er lett koblet til mangfoldet av åpninger, og hvori mangfoldet av åpninger i pakningen innrettes med mangfoldet av substratregioner av substratet når pakningen er montert på substratet;(3) dekselet omfatter et innløp og et utløp, innløpet er lett koblet til mangfoldet av inngangskanaler når dekselet er montert på pakningen, utløpet er lett koblet til mangfoldet av utgangskanaler når dekselet er montert på pakningen; og(4) mangfoldet av perfusjonskamre er definert av (i) mangfoldet av substratregioner av substratet, (ii) mangfoldet av åpninger i pakningen som er montert på substratet, og (iii) dekselet som er montert på pakningen;(b) å perfusere én eller flere testforbindelser gjennom perfusjonskammeret;(c) å registrere en cellulær aktivitet og/eller et intracellulært genuttrykk av en nukleinsyre av det levende vevet eller celleprøven,(d) å permeabilisere det levende vevet eller celleprøven slik at analytten er spesifikt bundet til fangstdomenet til fangstproben til mangfoldet av fangstprober;(e) å forlenge fangstproben ved 3'-enden ved å anvende analytten som er spesifikt bundet til fangstdomenet som en mal, og derved generere en forlenget fangstprobe;(f) å amplifisere den forlengede fangstproben for å fremstille et mangfold av forlengede fangstprober; og (g) å sekvensere (i) hele sekvensen til den romlige strekkoden, eller et komplement derav, og (ii) hele eller en del av sekvensen til analytten, eller et komplement derav, og å anvende de bestemte sekvensene til (i) og (ii) til å bestemme lokasjonen og lokasjonen og/eller forekomsten av analytten i det levende vevet eller celleprøven.
Hva betyr A1, B, B1, C osv? info
Innehaver i EP:
10X Genomics, Inc.
6230 Stoneridge Mall Road Pleasanton, CA 94588-3260 US
Pleasanton, California 94588-3260 US
Pleasanton, California 94588-3260 US
Pleasanton, California 94588-3260 US
Fullmektig i Norge:
RWS
RWS Compass House, Vanwall Business Park, Vanwall Road SL64UB MAIDENHEAD, BERKSHIRE GB
Din referanse: 1717586
Fullmektig i EP:
J A Kemp LLP
80 Turnmill Street London EC1M 5QU GB

2020.05.22, US 202063029121 P

2020.06.25, US 202063044028 P

LIU YANG ET AL: "High-Spatial-Resolution Multi-Omics Atlas Sequencing of Mouse Embryos via Deterministic Barcoding in Tissue", BIORXIV, 1 October 2019 (2019-10-01), XP055774345, Retrieved from the Internet <URL:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/788992v1.full.pdf> [retrieved on 20210210], DOI: 10.1101/788992 (B1)

WO-A1-2019/113457 (B1)

WO-A1-2018/064640 (B1)

WO-A1-2016/172362 (B1)

Statushistorie

Liste over statusendringer i sakshistorikk
Hovedstatus Beslutningsdato, detaljstatus
EP patent gjort gjeldende i Norge EP patent besluttet gjeldende i Norge
EP under behandling Forespørsel om å gjøre EP patent gyldig er mottatt

Korrespondanse

Liste over sakshistorikk og korrespondanse
Dato Type korrespondanse Journal beskrivelse
Utgående EP Varsel om betaling av første årsavgift (3319) (PTEP4153775)
08-01 Via Altinn-sending EP Varsel om betaling av første årsavgift (3319) (PTEP4153775)
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
07-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
06-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
05-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
04-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Utgående EP Registreringsbrev (3210) (PTEP4153775)
03-01 Brev UT EP Registreringsbrev (3210) (PTEP4153775)
Innkommende, AR635316357 Søknadsskjema Patent
01-01 Søknadsskjema Patent Søknadsskjema Patent
01-02 EP Krav 1717586ENNOb_Filing
01-03 Fullmakt NO_POA_EP4153775
01-04 Annet dokument PDF_635316357
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
02-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO

Til betaling:

Beskrivelse Forfallsdato Beløp Status
Årsavgift expand_less Ikke betalt
Årsavgift 5. avg. år (EP) 2150,0 Totalbeløp 2150,0   Gå til betaling

Betalingshistorikk:

Liste av betalinger
Beskrivelse / Fakturanummer Betalingsdato Beløp Betaler Status
32412604 expand_more 2024.09.27 7254 RWS Betalt
Denne oversikten kan mangle informasjon, spesielt for eldre saker, om tilbakebetaling, internasjonale varemerker og internasjonale design.

Lenker til publikasjoner og Norsk Patenttidende (søkbare tekstdokumenter)

Allment tilgjengelig patentsøknad
Hva betyr A1, B, B1, C osv? info
Kapitler uten data er fjernet. Melding opprettet: 01.05.2025 05:15:04