Nøkkelinformasjon info chevron_right

Viktig informasjon i saken hentes i sanntid direkte fra EPO sitt register (European Patent Register), slik at du enkelt og raskt får oversikt i saken.
Beskrivelse Verdi
Saken / databasen er sist oppdatert info  
Tittel DETECTING MUTATIONS FOR CANCER SCREENING AND FETAL ANALYSIS
Status
Hovedstatus
Detaljstatus 		I kraft info EP patent gjort gjeldende i Norge EP patent besluttet gjeldende i Norge
Patentnummer NO/EP3256605
Europeisk (EP) publiserings nummer EP3256605
EP levert
EP søknadsnummer 16748745.3
EP meddelt
Prioritet 2015.02.10, US 201562114471 P, .... se mer/flere nedenfor
Sakstype Europeisk
Løpedag
Utløpsdato
Allment tilgjengelig
Validert i Norge
Innehaver The Chinese University Of Hong Kong (CN)
Oppfinner LO, Yuk-Ming Dennis (CN) .... se mer/flere nedenfor
Fullmektig ZACCO NORWAY AS (NO)
Lenke til European patent Register Informasjon i saken, dokumenter og patentfamilie
Patentfamilie Se i Espacenet

Sammendrag og figur info chevron_right

EPO translation logo


Se forsidefigur og sammendrag i Espacenet

Beskrivelse og krav info chevron_right

T3

Beskrivelse

Krav

Patentkrav1. Fremgangsmåte for identifisering av somatiske mutasjoner hos et humant subjekt ved å analysere en biologisk prøve av det humane subjekt, idet den biologiske prøve innbefatter deoksyribonukleinsyre (DNA)-fragmenter som stammer fra normale celler og potensielt fra tumorceller eller celler assosiert med kreft, idet den biologiske prøve innbefatter cellefri DNA-fragmenter, idet fremgangsmåten omfatter å utføre, ved hjelp av et computersystem:å motta en eller flere sekvenslesninger for hvert av en flerhet av DNA-fragmenter i den biologiske prøve;å sammenstille flerheten av sekvenslesninger til et humant referansegenom under anvendelse av en første sammenstillingsfremgangsmåte for å bestemme genomiske posisjoner for flerheten av sekvenslesninger;å sammenligne sekvenslesningene med et konstitusjonelt genom som svarer til det humane subjekt, for å identifisere et filtrert sett av loci til å ha somatiske mutasjoner i et vev av det humane subjekt, hvor: på hvert locus av det filtrerte sett, er et antall av sekvenslesningene som har en sekvensvariant relativt til det konstitusjonelle genom, over en cutoffverdi, idet cutoff-verdien er større enn én;for hvert av et første sett av kandidatloci som er identifisert som potensielt å ha en somatisk mutasjon:å bestemme en størrelsesforskjell mellom en første gruppe av DNA-fragmenter som har sekvensvarianten, og en andre gruppe av DNA-fragmenter som har en villtype-allel;å sammenligne størrelsesforskjellen med en størrelsesterskelverdi; når størrelsesforskjellen er mindre enn størrelsesterskelverdien, å forkaste kandidatlocuset som en potensiell mutasjon; ogå identifisere det filtrerte sett av loci til å ha somatiske mutasjoner i det humane subjekt under anvendelse av de gjenværende kandidatloci.2. Fremgangsmåte ifølge krav 1, hvor å identifisere det filtrerte sett av loci til å ha somatiske mutasjoner i et vev av det humane subjekt, videre innbefatter: å identifisere en gruppe av regioner som er kjent for å være assosiert med histonmodifikasjoner som er assosiert med kreft;for hvert av et andre sett av kandidatloci som er identifisert som potensielt å ha en somatisk mutasjon:å bestemme hvorvidt kandidatlocuset er i én av gruppen av regioner;å bestemme hvorvidt kandidatlocuset skal forkastes på grunnlag av hvorvidt kandidatlocuset er i én av gruppen av regioner, hvor det kandidatlocus som ikke er i én av gruppen av regioner, tilveiebringer en høyere sannsynlighet for forkasting av kandidatlocuset enn når kandidatlocuset er i én av gruppen av regioner;å identifisere det filtrerte sett av loci til å ha somatiske mutasjoner under anvendelse av de gjenværende kandidatloci.3. Fremgangsmåte ifølge krav 1 eller 2, som videre omfatter: å bestemme en mutasjonslast for det humane subjekt under anvendelse av en mengde loci i det filtrerte sett av loci.4. Fremgangsmåte ifølge krav 3, hvor mutasjonslasten bestemmes som et råtall av somatiske mutasjoner, en tetthet av somatiske mutasjoner per antall av baser, en prosentsats av loci av en genomisk region som er identifisert til å ha somatiske mutasjoner, et antall av somatiske mutasjoner som er observert i en bestemt prøvemengde, eller en økning sammenlignet med en referanselast.5. Fremgangsmåte ifølge krav 3 eller 4, som videre omfatter: å sammenligne mutasjonslasten med en kreftterskelverdi for å bestemme et omfang av kreft.6. Fremgangsmåte ifølge krav 5, hvor omfanget av kreft indikerer en tumor, idet fremgangsmåten videre omfattende:å bestemme en første mengde av histodonmodifikasjoner for hvert av en første flerhet av segmenter av det humane referansegenom;å bestemme en andre mengde av det filtrerte sett av loci for hvert av en andre flerhet av segmenter av det humane referansegenom; å bestemme et første sett av segmenter som har den første mengde av histonmodifikasjoner over en første terskelverdi, og som har den andre mengde av det filtrerte sett av loci over en andre terskelverdi; ogå identifisere et opphavsvev av tumoren basert på det første sett av segmenter.7. Fremgangsmåte ifølge krav 1, hvor å identifisere det filtrerte sett av loci til å ha somatiske mutasjoner i et vev av det humane subjekt, videre innbefatter:for hvert av et andre sett av kandidatloci som er identifisert som potensielt å ha en somatisk mutasjon:å bestemme en fraksjon av sekvenslesninger som har sekvensvarianten; å sammenligne fraksjonen med en fraksjonsterskelverdi;å bestemme hvorvidt kandidatlocuset skal forkastes som en potensiell mutasjon basert på sammenligningen, hvor den fraksjon som er mindre enn fraksjonterskelverdien, tilveiebringer en høyere sannsynlighet for forkasting av kandidatlocuset enn den fraksjon som er større enn fraksjonsterskelverdien; ogå identifisere det filtrerte sett av loci til å ha somatiske mutasjoner i det humane subjekt under anvendelse av de gjenværende kandidatloci.8. Fremgangsmåte ifølge krav 7, som videre omfatter: å måle en fraksjonert konsentrasjon av tumor-DNA i den biologiske prøve, hvor fraksjonsterskelverdien bestemmes basert på den fraksjonerte konsentrasjon.9. Fremgangsmåte ifølge krav 7 eller 8, som videre omfatter: å identifisere én eller flere aberrante regioner som har en kopitallsaberrasjon, hvor fraksjonsterskelverdien som anvendes for et kandidatlocus i en aberrant region, er avhengig av hvorvidt den aberrante region utviser en kopitallsøkning eller et kopitallstap.10. Fremgangsmåte ifølge krav 7 eller 8, som videre omfatter:å identifisere én eller flere aberrante regioner som har en kopitallsaberrasjon; og å identifisere at en første sekvenslesning fra en første aberrant region som utviser en kopitallsøkning, med større sannsynlighet har en somatisk mutasjon enn en andre sekvenslesning fra en andre aberrant region som utviser et kopitallstap, som del av å bestemme hvorvidt sekvenslesninger for å bestemme antallet av sekvenslesninger som har en sekvensvariant relativt til det konstitusjonelle genom for hvert av det filtrerte sett av loci, skal forkastes.11. Fremgangsmåte ifølge krav 10, hvor den ene eller de flere aberrante regioner defineres ved:for hvert av det andre sett av kandidatloci som er identifisert som potensielt å ha en somatisk mutasjon:å beregne en tilsynelatende mutant fraksjon av en sekvensvariant relativ til det konstitusjonelle genom;for hver av en flerhet av regioner:å bestemme en varians i de tilsynelatende mutante fraksjoner av kandidatlociene i den aberrante region;å sammenligne variansen med en variansterskelverdi, hvor en aberrant region som utviser en kopitallsøkning, har en varians som er større enn variansterskelverdien.12. Fremgangsmåte ifølge krav 1, hvor sekvenseringen er metyleringsbevisst sekvensering, og hvor å identifisere det filtrerte sett av loci til å ha somatiske mutasjoner i et vev av det humane subjekt, videre innbefatter:for hvert av et andre sett av kandidatloci som er identifisert som potensielt å ha en somatisk mutasjon:for hver av sekvenslesningene som er sammenstilt til kandidatlocuset og har sekvensvarianten:å bestemme en metyleringsstatus av det tilsvarende analyserbare DNA-molekyl på ett eller flere steder;å bestemme hvorvidt sekvenslesningen skal forkastes basert på metyleringsstatusen, hvor den metyleringsstatus som ikke metyleres, tilveiebringer en høyere sannsynlighet for å forkaste sekvenslesningen enn den metyleringsstatus som metyleres, idet det derved oppnås et antall gjenværende sekvenslesninger;å sammenligne antallet av gjenværende sekvenslesninger med en kandidatterskelverdi; ogå bestemme hvorvidt kandidatlocuset skal forkastes basert på sammenligningen av antallet av gjenværende sekvenslesninger med kandidatterskelverdien, hvor det antall av gjenværende sekvenslesninger som er mindre enn kandidatterskelverdien, tilveiebringer en høyere sannsynlighet for å forkaste kandidatlocuset enn det antall av gjenværende sekvenslesninger som er større enn kandidatterskelverdien; ogå identifisere det filtrerte sett av loci til å ha somatiske mutasjoner under anvendelse av de gjenværende kandidatloci.13. Fremgangsmåte ifølge krav 1, hvor å identifisere det filtrerte sett av loci til å ha somatiske mutasjoner i et vev av det humane subjekt, videre innbefatter:for hvert av et andre sett av kandidatloci som er identifisert som potensielt å ha en somatisk mutasjon:for hver av sekvenslesningene som er sammenstilt til kandidatlocuset og har sekvensvarianten:å bestemme en endeposisjon som svarer til hvor en ende av sekvenslesningen sammenstilles;å sammenligne endeposisjonen med en flerhet av kreftspesifikke eller kreftassosierte sluttposisjoner;å bestemme hvorvidt sekvenslesningen skal forkastes basert på sammenligningen, hvor den endeposisjon som ikke er en kreftspesifikk eller kreftassosiert sluttposisjon, tilveiebringer en høyere sannsynlighet for å forkaste sekvenslesningen enn den endeposisjon som er en kreftspesifikk eller kreftassosiert sluttposisjon, idet det derved oppnås et antall gjenværende sekvenslesninger;å sammenligne antallet av gjenværende sekvenslesninger med en kandidatterskelverdi; ogå bestemme hvorvidt kandidatlocuset skal forkastes basert på sammenligningen av antallet av gjenværende sekvenslesninger med kandidatterskelverdien, hvor det antall av gjenværende sekvenslesninger som er mindre enn kandidatterskelverdien, tilveiebringer en høyere sannsynlighet for å forkaste kandidatlocuset enn det antall av gjenværende sekvenslesninger som er større enn kandidatterskelverdien; ogå identifisere det filtrerte sett av loci til å ha somatiske mutasjoner under anvendelse av de gjenværende kandidatloci.14. Fremgangsmåte ifølge krav 1, hvor sekvenseringen utføres under anvendelse av en enkeltstrenget sekvensering-bibliotektillagingsfremgangsmåte som tilveiebringer et etterfølgende sekvenseringstrinn for å gi to strenglesninger for hvert mal-DNA-molekyl, hvor å identifisere det filtrerte sett av loci til å ha somatiske mutasjoner i et vev av det humane subjekt, videre innbefatter:for hvert av et andre sett av kandidatloci som er identifisert som potensielt å ha en somatisk mutasjon:for hvert par av strenglesninger som sammenstilles til kandidatlocuset: å bestemme hvorvidt begge strenger har sekvensvarianten;å bestemme hvorvidt sekvenslesningen skal forkastes basert på hvorvidt begge strenger har sekvensvarianten, hvor begge strenger som ikke har sekvensvarianten, tilveiebringer en høyere sannsynlighet for å forkaste strenglesningene enn den kun ene strenglesning som har sekvensvarianten, idet det derved oppnås et antall gjenværende sekvenslesninger;å sammenligne antallet av gjenværende sekvenslesninger med en kandidatterskelverdi; ogå bestemme hvorvidt kandidatlocuset skal forkastes basert på sammenligningen av antallet av gjenværende sekvenslesninger med kandidatterskelverdien, hvor det antall av gjenværende sekvenslesninger som er mindre enn kandidatterskelverdien, tilveiebringer en høyere sannsynlighet for å forkaste kandidatlocuset enn det antall av gjenværende sekvenslesninger som er større enn kandidatterskelverdien; ogå identifisere det filtrerte sett av loci til å ha somatiske mutasjoner under anvendelse av de gjenværende kandidatloci. 15. Fremgangsmåte ifølge et hvilket som helst av de foregående krav, hvor cellefri DNA-fragmenter fra tumorceller eller celler assosiert med kreft omfatter mindre enn 50% av de cellefri DNA-fragmenter i den biologiske prøve.16. Computerprogram omfattende en flerhet av instruksjoner som kan kjøres på et computersystem, som når således kjørt styrer computersystemet til å utføre en operasjon ifølge et hvilket som helst av de foregående krav.
Hva betyr A1, B, B1, C osv? info

Klasser info chevron_right

IPC-klasse

G16B 20/00 G16B 30/00  

Innehaver(e) info chevron_right

Innehaver i EP:
The Chinese University Of Hong Kong
Office of Research and Knowledge Transfer Services (ORKTS) Room 301Pi Ch'iu Building Shatin New Territories Hong Kong 999077 CN

Oppfinner(e) info chevron_right

LO, Yuk-Ming Dennis
4th Floor 7 King Tak Street Homantin Kowloon Hong Kong 999077 CN
CHIU, Rossa Wai Kwun
House 31 Double Haven 52 Ma Lok Path Shatin New Territories Hong Kong 999077 CN
CHAN, Kwan Chee
Flat C 15th Floor Block 5 Peak One Mei Tin Road Shatin New Territories Hong Kong 999077 CN
JIANG, Peiyong
Flat 7 on 1st Floor of Block B of Kwong Lam Court Nos. 62-66 (No.62) Siu Lek Yuen Road Shatin New Territories Hong Kong CN

Fullmektig info chevron_right

Fullmektig i Norge:
ZACCO NORWAY AS
Postboks 488 0213 OSLO NO ( OSLO kommune, Oslo fylke )

Org.nummer: 982702887
Din referanse: V439255NO00
  • Foretaksnavn:
  • Foretaksform:
  • Næring:
  • Forretningsadresse:
     

Kilde: Brønnøysundregistrene
Fullmektig i EP:
J A Kemp LLP
80 Turnmill Street London EC1M 5QU GB

Prioritet info chevron_right

2015.02.10, US 201562114471 P

2015.12.22, US 201562271196 P

Anførte dokumenter info chevron_right

DAVID L GOODE ET AL: "A simple consensus approach improves somatic mutation prediction accuracy", GENOME MEDICINE,, vol. 5, no. 9, 30 September 2013 (2013-09-30), page 90, XP021165732, ISSN: 1756-994X, DOI: 10.1186/GM494 (B1)

KRISTIAN CIBULSKIS ET AL: "Sensitive detection of somatic point mutations in impure and heterogeneous cancer samples", NATURE BIOTECHNOLOGY, vol. 31, no. 3, 10 February 2013 (2013-02-10), pages 213-219, XP055256219, ISSN: 1087-0156, DOI: 10.1038/nbt.2514 (B1)

MARYAM HEIDARY ET AL: "The dynamic range of circulating tumor DNA in metastatic breast cancer", BREAST CANCER RESEARCH, CURRENT MEDICINE GROUP LTD, GB, vol. 16, no. 4, 9 August 2014 (2014-08-09) , page 421, XP021196558, ISSN: 1465-5411, DOI: 10.1186/S13058-014-0421-Y (B1)

WO-A1-2014/130890 (B1)

US-A1- 2015 087 529 (B1)

WO-A1-2014/039556 (B1)

US-A1- 2014 100 121 (B1)

Sakshistorikk info chevron_right

Statushistorie

Liste over statusendringer i sakshistorikk
Hovedstatus Beslutningsdato, detaljstatus
EP patent gjort gjeldende i Norge EP patent besluttet gjeldende i Norge
EP under behandling Forespørsel om å gjøre EP patent gyldig er mottatt

Korrespondanse

expand_more file_download  
Liste over sakshistorikk og korrespondanse
Dato Type korrespondanse Journal beskrivelse
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
19-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
18-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
17-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
16-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
15-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
14-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
13-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
12-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
11-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
10-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
09-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
08-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
07-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
06-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
05-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
04-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Utgående EP Registreringsbrev (3210) (PTEP3256605)
03-01 Brev UT EP Registreringsbrev (3210) (PTEP3256605)
Innkommende Søknadsskjema Patent
01-01 Søknadsskjema Patent Søknadsskjema Patent
01-02 Fullmakt N411492EP-(NO) Power of Attorney_10090603
01-03 Hovedbrev NO_Validation_Request_Mar_10,_2022_248318
01-04 EP oversettelse V439255NO00 NO claims 248304
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
02-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Informasjon om ikke tilgjengelige dokumenter

Betaling info chevron_right

Til betaling:

Neste fornyelse/årsavgift:

Betalingshistorikk:

Liste av betalinger
Beskrivelse / Fakturanummer Betalingsdato Beløp Betaler Status
Årsavgift 10. avg. år (EP) 2025.02.12 4160 CPA GLOBAL LIMITED Betalt og godkjent
Årsavgift 9. avg. år (EP) 2024.02.08 2850 CPA GLOBAL LIMITED Betalt og godkjent
Årsavgift 8. avg. år (EP) 2023.02.08 2550 CPA GLOBAL LIMITED Betalt og godkjent
32204017 expand_more 2022.03.16 5500 ZACCO NORWAY AS Betalt
Årsavgift 7. avg. år (EP) 2022.02.25 2200 CPA GLOBAL LIMITED Betalt og godkjent
Denne oversikten kan mangle informasjon, spesielt for eldre saker, om tilbakebetaling, internasjonale varemerker og internasjonale design.

Publikasjon(er) info chevron_right

Lenker til publikasjoner og Norsk Patenttidende (søkbare tekstdokumenter)

Oversettelse av europeisk patentskrift
Allment tilgjengelig patentsøknad
Norsk Patenttidende - ved meddelelse
Nye digitale Norske Tidende, nyhet om tjenesten ved lansering
Om Norske Tidende
Hva betyr A1, B, B1, C osv? info
Kapitler uten data er fjernet. Melding opprettet: 24.04.2025 07:04:04