Viktig informasjon i saken hentes i sanntid direkte fra EPO sitt register (European Patent Register), slik at du enkelt og raskt får oversikt i saken.
Beskrivelse Verdi
Saken / databasen er sist oppdatert info  
Tittel METHODS AND PROCESSES FOR NON-INVASIVE ASSESSMENT OF GENETIC VARIATIONS
Status
Hovedstatus
Detaljstatus
I kraft info EP patent gjort gjeldende i Norge EP patent besluttet gjeldende i Norge
Patentnummer NO/EP3053071
Europeisk (EP) publiserings nummer EP3053071
EP levert
EP søknadsnummer 14790884.2
EP meddelt
Prioritet 2013.10.04, US 201361887081 P
Sakstype Europeisk
Løpedag
Utløpsdato
Allment tilgjengelig
Validert i Norge
Innehaver Sequenom, Inc. (US)
Oppfinner HANNUM, Gregory (US)
Fullmektig Novagraaf Brevets (FR)
Lenke til European patent Register Informasjon i saken, dokumenter og patentfamilie
Patentfamilie Se i Espacenet

EPO translation logo


Se forsidefigur og sammendrag i Espacenet

T3

Beskrivelse

Krav

PATENTKRAV1. Fremgangsmåte for å bestemme tilstedeværelsen eller fraværet av en kromosomaneuplodi for en prøve, omfattende:(a) å filtrere, i henhold til en lesetetthetsfordeling, deler av et referansegenom, for derved å tilveiebringe en lesetetthetsprofil for en testprøve omfattende lesetettheter av filtrerte deler, hvori:(i) lesetetthetene omfatter kvantitative mål på tellinger av sekvensavlesninger kartlagt til delene av referansegenomet, hvori sekvensavlesningene er avlesninger av sirkulerende cellefri nukleinsyre fra en testprøve fra en gravid kvinne, og (ii) lesetetthetsfordelingen er en fordeling av gjennomsnittlige, midlere eller median lesetettheter, og bestemmes for lesetettheter av deler for flere prøver; (b) å justere lesetetthetsprofilen for testprøven ved 1) å subtrahere en opplært medianverdi fra testprøvelesetettheter og 2) å fjerne komponenter i testprøvelesetettheter som korrelerer med én eller flere hovedkomponenter fra profilen, hovedkomponentene (i) oppnås fra et opplæringssett av kjente euploide prøver ved en hovedkomponentanalyse, og (ii) representerer én eller flere skjevheter i en lesetetthetsprofil, og tilveiebringer derved en justert lesetetthetsprofil omfattende justerte lesetettheter, hvori et mangfold av skjevheter fjernes fra den justerte lesetetthetsprofilen;(c) å sammenligne den justerte lesetetthetsprofilen med en referanseprofil omfattende lesetettheter oppnådd fra én eller flere referanseprøver, for derved å tilveiebringe en sammenligning; og(d) å bestemme tilstedeværelsen eller fraværet av en kromosomaneuploidi for testprøven i henhold til sammenligningen, hvori én eller flere eller alle behandlingsfremgangsmåtene utføres av en prosessor, en mikroprosessor, en datamaskin, i forbindelse med minne og/eller av et mikroprosessorstyrt apparat. 2. Fremgangsmåten ifølge krav 1, hvori lesetetthetsprofilen justeres i (b) med 2 til 10 hovedkomponenter. 3. Fremgangsmåten ifølge krav 1 eller 2, hvori sammenligningen i (c) omfatter å bestemme et signifikansnivå, hvori signifikansnivået indikerer en statistisk signifikant forskjell mellom den justerte lesetetthetsprofilen og referanseprofilen, og tilstedeværelsen av en kromosomaneuploidi er bestemt. 4. Fremgangsmåten ifølge krav 3, hvori å bestemme signifikansnivået omfatter å bestemme en p-verdi.5. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1 til 4, hvori referanseprofilen i (c) omfatter:(i) lesetettheter bestemt for én eller flere kjente euploide prøver;(ii) lesetettheter av filtrerte deler; og/eller(iii) lesetettheter justert i henhold til den ene eller flere hovedkomponentene.6. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1 til 5, hvori:(i) lesetetthetene til delene for de flere prøvene i (a)(ii) er median lesetettheter;(ii) lesetetthetene til filtrerte deler for testprøven er median lesetettheter; og/eller(iii) lesetetthetene for referanseprofilen i (c) er median lesetettheter.7. Fremgangsmåten ifølge krav 6, hvori lesetetthetene for lesetetthetsprofilen for testprøven, lesetetthetene til deler for de flere prøvene i (a)(ii), og lesetetthetene for referanseprofilen i (c) bestemmes i henhold til en prosess omfattende anvendelse av en kjernetetthetsestimering.8. Fremgangsmåten krav 6 eller 7, hvori lesetetthetsprofilen for testprøven bestemmes i henhold til median lesetetthetene for testprøven; og referanseprofilen i (c) bestemmes i henhold til median lesetetthetene for den ene eller flere referanseprøvene. 9. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1 til 8, hvori deler av et referansegenom filtreres i (a) i henhold til et mål på usikkerhet for lesetetthetsfordelingen.10. Fremgangsmåten ifølge krav 9, hvori målet for usikkerhet er en MAD. 11. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1 til 10, hvori lesetetthetsprofilen for testprøven og referanseprofilen i (c) omfatter z-score av lesetettheter.12. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1 til 11, hvori lesetetthetsprofilen for testprøven er representativ for kromosomdosering for testprøven, og fremgangsmåten omfatter å sammenligne kromosomdosering for lesetetthetsprofilen for testprøven med kromosomdosering for referanseprofilen i (c), for derved å generere en kromosomdosesammenligning, hvori å bestemme tilstedeværelsen eller fraværet av en kromosomaneuploidi for testprøven er i henhold til kromosomdosesammenligningen.13. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1 til 12, hvori å bestemme tilstedeværelsen eller fraværet av en kromosomaneuploidi for testprøven omfatter å identifisere tilstedeværelsen eller fraværet av en kopi av et kromosom, to kopier av et kromosom, tre kopier av et kromosom, fire kopier av et kromosom, fem kopier av et kromosom, en sletting av ett eller flere segmenter av et kromosom eller en innsetting av ett eller flere segmenter av kromosom.14. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1 til 13, omfattende, før (a), å oppnå sekvensavlesningene.15. Fremgangsmåten ifølge et hvilket som helst av kravene 1 til 14, omfattende, før (b), å justere lesetetthetsprofilen for testprøven med en GC LOESS-normalisering.
Hva betyr A1, B, B1, C osv? info
Innehaver i EP:
Sequenom, Inc.
3595 John Hopkins Court San Diego, CA 92121 US
13125 Bavarian Drive San Diego, CA 92129 US
Fullmektig i Norge:
Novagraaf Brevets
Bâtiment O2, 2 rue Sarah Bernhardt CS90017 92665 ASNIÈRES-SUR-SEINE CEDEX FR
Din referanse: BB239789EPNO
Fullmektig i EP:
Vossius & Partner Patentanwälte Rechtsanwälte mbB
Siebertstrasse 3 81675 München DE

2013.10.04, US 201361887081 P

US-A1- 2013 261 983 (B1)

WO-A2-2014/190286 (B1)

WEI ZHENG ET AL: "Bias detection and correction in RNA-Sequencing data", BMC BIOINFORMATICS, BIOMED CENTRAL, LONDON, GB, vol. 12, no. 1, 19 July 2011 (2011-07-19), page 290, XP021104600, ISSN: 1471-2105, DOI: 10.1186/1471-2105-12-290 (B1)

Statushistorie

Liste over statusendringer i sakshistorikk
Hovedstatus Beslutningsdato, detaljstatus
EP patent gjort gjeldende i Norge EP patent besluttet gjeldende i Norge
EP under behandling Forespørsel om å gjøre EP patent gyldig er mottatt

Korrespondanse

Liste over sakshistorikk og korrespondanse
Dato Type korrespondanse Journal beskrivelse
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
15-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
14-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Utgående EP Varsel om betaling av første årsavgift (3319) (PTEP3053071)
13-01 Brev UT EP Varsel om betaling av første årsavgift (3319) (PTEP3053071)
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
12-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
11-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
10-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
09-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
08-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
07-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
06-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Utgående EP Registreringsbrev (3210) (PTEP3053071)
05-01 Brev UT EP Registreringsbrev (3210) (PTEP3053071)
Innkommende Korrespondanse (Hovedbrev inn)
04-01 Korrespondanse (Hovedbrev inn) Korrespondanse (Hovedbrev inn)
04-02 Fullmakt POA_S_NO_SEQUE_517142
Utgående EP Formelle mangler
03-01 Brev UT EP Formelle mangler
Innkommende Søknadsskjema Patent
01-01 Søknadsskjema Patent Søknadsskjema Patent
01-02 Annet dokument FORM_B1_BB239789EPNO
01-03 EP Krav TRANSL_NO_BB239789EPNO
01-04 Hovedbrev VAL_FORM_BB239789EPNO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
02-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO

Til betaling:

Beskrivelse Forfallsdato Beløp Status
Årsavgift expand_less Ikke betalt
Årsavgift 12. avg. år (EP) 5010,0 Totalbeløp 5010,0   Gå til betaling

Betalingshistorikk:

Liste av betalinger
Beskrivelse / Fakturanummer Betalingsdato Beløp Betaler Status
Årsavgift 11. avg. år (EP) expand_more 2025.01.21 5250,0 PAVIS PAYMENTS GMBH Betalt og godkjent
32400978 expand_more 2024.01.22 5500 Novagraaf Brevets Betalt
Denne oversikten kan mangle informasjon, spesielt for eldre saker, om tilbakebetaling, internasjonale varemerker og internasjonale design.

Lenker til publikasjoner og Norsk Patenttidende (søkbare tekstdokumenter)

Allment tilgjengelig patentsøknad
Hva betyr A1, B, B1, C osv? info
Kapitler uten data er fjernet. Melding opprettet: 01.05.2025 05:02:54