Nøkkelinformasjon info chevron_right

Viktig informasjon i saken hentes i sanntid direkte fra EPO sitt register (European Patent Register), slik at du enkelt og raskt får oversikt i saken.
Beskrivelse Verdi
Saken / databasen er sist oppdatert info  
Tittel METHODS TO DETECT RARE MUTATIONS AND COPY NUMBER VARIATION
Status
Hovedstatus
Detaljstatus 		Ikke i kraft info Patent opphevet EP-patent opphevet etter innsigelse i EPO
Patentnummer NO/EP2893040
Europeisk (EP) publiserings nummer EP2893040
EP levert
EP søknadsnummer 13834427.0
EP meddelt
Prioritet 2012.09.04, US 201261696734 P, .... se mer/flere nedenfor
Sakstype Europeisk
Løpedag
Utløpsdato
Allment tilgjengelig
Validert i Norge
Innehaver Guardant Health, Inc. (US)
Oppfinner TALASAZ, AmirAli (US) .... se mer/flere nedenfor
Fullmektig AWA NORWAY AS (NO)
Lenke til European patent Register Informasjon i saken, dokumenter og patentfamilie
Patentfamilie Se i Espacenet

Sammendrag og figur info chevron_right

EPO translation logo


Se forsidefigur og sammendrag i Espacenet

Beskrivelse og krav info chevron_right

T3

Beskrivelse

Krav

Krav1. Fremgangsmåte omfattende:a. å tilveiebringe minst ett sett av merkede opphavspolynukleotider ved å konvertere innledende startegenetisk materiale til de merkede opphavspolynukleotidene, hvor det initiale startegenetiske materialet omfatter mellom 100 og 100000 haploide humane genomekvivalenter av cellefrie DNA-polynukleotider, og merkingen er med mellom 2 og 1000000 unike identifikatorer;og for hvert sett av merkede opphavspolynukleotider;b. amplifisering av de merkede opphavspolynukleotidene i settet for å fremstille et tilsvarende sett av amplifiserte avkom-polynukleotider; c. sekvensering av et subsett av settet av amplifiserte avkompolynukleotider, for å produsere et sett av sekvenseringsavlesninger; ogd. å kollapse settet av sekvenseringsavlesninger for å generere et sett av konsensussekvenser, idet hver konsensussekvens tilsvarer et unikt polynukleotid blant settet av merkede opphavspolynukleotider, hvor fremstillingen av konsensussekvenser er basert på informasjon fra markøren og minst en av (i) sekvensinformasjon i begynnelsesområdet av sekvenseringsavlesningen (ii) sekvensinformasjon ved endeområdet av sekvenseringsavlesningen, og (iii) lengden av sekvenseringsavlesningen.2. Fremgangsmåte ifølge krav 1, hvor hvert polynukleotid i et sett kan kartlegges i en referansesekvens.3. Fremgangsmåte ifølge krav 1 omfattende å tilveiebringe et antall av sett av merkede opphavspolynukleotider, hvor hvert sett kan kartlegges til en annen kartleggbar posisjon i referansesekvensen.4. Fremgangsmåte ifølge krav 1, som videre omfatter: (e) analyse av settet av konsensussekvenser for hvert sett av merkede opphavspolynukleotider separat eller i kombinasjon. 5. Fremgangsmåte ifølge et av de foregående krav, hvor det initiale startegenetiske materialet ikke inneholder mer enn 100 ng polynukleotider.6. Fremgangsmåte ifølge et hvilket som helst av de foregående krav omfattende omdannelse av det initiale startegenetiske materialet til merkede opphavspolynukleotider med en konverteringseffektivitet på minst 10 %, minst 20 %, minst 30 %, minst 40 %, minst 50 %, minst 60 %, minst 80 % eller minst 90 %.7. Fremgangsmåte ifølge et hvilket som helst av de foregående krav, hvor omdannelsen omfatter en hvilken som helst av butt-ende-ligering, klebrig-endeligering, molekylære inversjonsprober, PCR, ligeringsbasert PCR, enkelstrengsligering og enkeltstreng-sirkularisering.8. Fremgangsmåte ifølge krav 2, hvor et antall av sett kartlegger til forskjellige kartleggbare posisjoner i en referansesekvens fra det samme genom.9. Fremgangsmåte ifølge krav 4 omfattende å tilveiebringe et antall av sett av merkede opphavspolynukleotider, hvor hvert sett er kartleggbart til en annen kartleggbar posisjon i en referansesekvens, og hvor den kartleggbare posisjon i referansesekvensen er lokus av en tumormarkør og analyse omfatter å detektere svulstmarkøren i settet av konsensussekvenser.10. Fremgangsmåte ifølge krav 4 omfattende å tilveiebringe et antall av sett av merkede opphavspolynukleotider, hvor hvert sett er kartleggbart til en annen kartleggbar posisjon i en referansesekvens, og hvor den kartleggbare posisjonen i referansesekvensen omfatter et antall av kartleggbare posisjoner i referansesekvensen, idet hver kartleggbar posisjon er lokus av en tumormarkør.11. Fremgangsmåte ifølge krav 4 omfattende å tilveiebringe et antall av sett av merkede opphavspolynukleotider, hvor hvert sett er kartleggbart til en annen kartleggbar posisjon i en referansesekvens, og hvor analysen omfatter (i) å detektere kopi-antall-variasjon av konsensussekvensene mellom i det minste to sett av opphavspolynukleotider; (ii) å detektere tilstedeværelsen av sekvensvariasjoner sammenlignet med referansesekvensene; eller (iii) å detektere tilstedeværelsen av sekvensvarianter sammenlignet med referansesekvensene og detektere kopi-antall-variasjon av konsensussekvenser mellom minst to sett av opphavspolynukleotider. 12. Fremgangsmåte ifølge et hvilket som helst av de foregående krav, hvor subsettet av settet av amplifiserte avkom-polynukleotider som er sekvensert, har en tilstrekkelig størrelse slik at hvilken som helst nukleotidsekvens representert i settet av merkede opphavspolynukleotider med en prosentandel som er den samme som prosentandelen av per-base-sekvenseringsfeil-frekvens av den anvendte sekvenseringsplattformen har minst 50 %, minst 60 %, minst 70 %, minst 80 %, minst 90 % minst 95 %, minst 98 %, minst en 99 %, minst en 99,9 % eller minst en 99,99 % sjanse for å bli representert blant settet av konsensussekvenser.13. Fremgangsmåte ifølge et av de foregående krav omfattende å anrike settet av amplifiserte avkom-polynukleotider med polynukleotider som kartlegger til en eller flere utvalgte kartleggbare posisjoner i en referansesekvens ved: (i) selektiv amplifikasjon av sekvenser fra innledende startegenetisk materiale omdannet til merkede opphavspolynukleotider; (ii) selektiv amplifisering av merkede opphavspolynukleotider; (iii) selektiv sekvensfangst av amplifiserte avkompolynukleotider; eller (iv) selektiv sekvensfangst av innledende startegenetisk materiale.14. Fremgangsmåte ifølge krav 4, hvor analysen omfatter å detektere mutasjoner, sjeldne mutasjoner, indeler, kopi-antall-variasjoner, transversjoner, translokasjoner, inversjon, deletjoner, aneuploidi, partiell aneuploidi, polyploidi, kromosomal ustabilitet, kromosomal-struktur forandringer, genfusjoner, kromosomal fusjoner, gen-trunkeringer, genforsterkning, genduplikasjoner, kromosomallesjoner, DNA-lesjoner, unormale endringer i nukleinsyre-kjemiske modifikasjoner, unormale endringer i epigenetiske pattemer, unormale endringer i nukleinsyremetyleringsmønster eller kreft.15. Fremgangsmåte ifølge krav 4, hvor analysen videre omfatter deteksjon og overvåkning av en abnormitet eller sykdom i et individ, slik som infeksjon og/eller kreft; eventuelt hvor fremgangsmåten utføres i kombinasjon med immunrepertoarprofilering.16. Fremgangsmåte ifølge et hvilket som helst av de foregående krav, hvor polynukleotidene ekstraheres fra en prøve valgt fra gruppen bestående av blod, plasma, serum, urin, spytt, slimhinneutskillelser, sputum, avføring og tårer. 17. Fremgangsmåte ifølge et av de foregående krav, omfattende å filtrere ut avlesninger, med en nøyaktighet eller kvalitetsgrad på mindre enn en terskelverdi.18. Fremgangsmåte ifølge et hvilket som helst av de foregående krav, hvor antallet unike identifikatorer er:i. minst 3 og maksimalt 1 000 000;ii. minst 5 og maksimalt 1 000 000;iii. minst 10 og maksimalt 1 000 000;iv. minst 15 og maksimalt 1 000 000;v. minst 25 og maksimalt 1 000 000;vi. minst 2 og maksimalt 100;vii. minst 2 og maksimalt 1 000;viii. minst 2 og maksimalt 10 000; ellerix. minst 2 og maksimalt 100 000.
Hva betyr A1, B, B1, C osv? info

Klasser info chevron_right

IPC-klasse

C12Q 1/68  

Innehaver(e) info chevron_right

Innehaver i EP:
Guardant Health, Inc.
3100 Hanover Street Palo Alto, CA 94304 US

Oppfinner(e) info chevron_right

TALASAZ, AmirAli
2181 Camino A Los Cerros Menlo Park, CA 94025 US
ELTOUKHY, Helmy
2 Barry Lane Atherton, CA 94027 US

Fullmektig info chevron_right

Fullmektig i Norge:
AWA NORWAY AS
Postboks 1052 Hoff 0218 OSLO NO ( OSLO kommune, Oslo fylke )

Org.nummer: 925400262
Din referanse: 174647 OC/GTBD
  • Foretaksnavn:
  • Foretaksform:
  • Næring:
  • Forretningsadresse:
     

Kilde: Brønnøysundregistrene
Fullmektig i EP:
Carpmaels & Ransford LLP
One Southampton Row London WC1B 5HA GB

Prioritet info chevron_right

2012.09.04, US 201261696734 P

2012.09.21, US 201261704400 P

2013.03.15, US 201361793997 P

2013.07.13, US 201361845987 P

Anførte dokumenter info chevron_right

M. W. SCHMITT ET AL: "Detection of ultra-rare mutations by next-generation sequencing", PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES, vol. 109, no. 36, 1 August 2012 (2012-08-01), pages 14508 - 14513, XP055161683, ISSN: 0027-8424, DOI: 10.1073/pnas.1208715109 (B1)

SCHMITT ET AL.: "Detection of ultra-rare mutations by next- generation sequencing", PNAS, vol. 109, no. 36, 1 August 2012 (2012-08-01), pages 14508 - 14513, XP055161683 (B1)

TSAI ET AL.: "Discovery of rare mutations in populations: TILLING by sequencing", PLANT PHYSIOLOGY, vol. 156, no. 3, 29 April 2011 (2011-04-29), pages 1257 - 1268, XP055051938 (B1)

US-A1- 2012 046 877 (B1)

WO-A1-2012/106559 (B1)

US-A1- 2012 214 678 (B1)

US-B1- 8 209 130 (B1)

WO-A1-2008/154317 (B1)

US-A1- 2012 100 548 (B1)

Sakshistorikk info chevron_right

Statushistorie

Liste over statusendringer i sakshistorikk
Hovedstatus Beslutningsdato, detaljstatus
Patent opphevet EP-patent opphevet etter innsigelse i EPO
EP patent gjort gjeldende i Norge EP patent besluttet gjeldende i Norge
EP under behandling Forespørsel om å gjøre EP patent gyldig er mottatt

Korrespondanse

expand_more file_download  
Liste over sakshistorikk og korrespondanse
Dato Type korrespondanse Journal beskrivelse
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
26-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Utgående EP Påminnelse om ikke betalt årsavgift (3331) (PTEP2893040)
25-01 Via Altinn-sending EP Påminnelse om ikke betalt årsavgift (3331) (PTEP2893040)
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
24-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
23-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
22-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
21-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
20-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
19-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
18-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
17-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
16-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
15-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
14-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
13-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
12-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
11-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
10-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
09-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
08-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
07-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
06-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
05-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Utgående EP Varsel om betaling av første årsavgift (3319) (PTEP2893040)
04-01 Via Altinn-sending EP Varsel om betaling av første årsavgift (3319) (PTEP2893040)
Utgående EP Registreringsbrev (3210) (PTEP2893040)
03-01 Brev UT EP Registreringsbrev (3210) (PTEP2893040)
Innkommende, AR305712810 Søknadsskjema Patent
01-01 Søknadsskjema Patent Søknadsskjema Patent
01-02 EP oversettelse EP krav
01-03 Fullmakt Fullmakt
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
02-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Informasjon om ikke tilgjengelige dokumenter

Betaling info chevron_right

Til betaling:

Betalingshistorikk:

Liste av betalinger
Beskrivelse / Fakturanummer Betalingsdato Beløp Betaler Status
Årsavgift 11. avg. år (EP) 2023.09.27 3500 COMPUTER PACKAGES INC. Betalt og godkjent
Årsavgift 10. avg. år (EP) 2022.09.28 3200 COMPUTER PACKAGES INC. Betalt og godkjent
Årsavgift 9. avg. år (EP) 2021.09.29 2850 COMPUTER PACKAGES INC. Betalt og godkjent
Årsavgift 8. avg. år (EP) 2020.09.29 2550 COMPUTER PACKAGES INC. Betalt og godkjent
Årsavgift 7. avg. år (EP) 2019.09.27 2200 COMPUTER PACKAGES INC. Betalt og godkjent
31902878 expand_more 2019.03.04 5500 OSLO PATENTKONTOR AS Betalt
Denne oversikten kan mangle informasjon, spesielt for eldre saker, om tilbakebetaling, internasjonale varemerker og internasjonale design.

Publikasjon(er) info chevron_right

Lenker til publikasjoner og Norsk Patenttidende (søkbare tekstdokumenter)

Oversettelse av europeisk patentskrift
Allment tilgjengelig patentsøknad
Norsk Patenttidende - ved meddelelse
Nye digitale Norske Tidende, nyhet om tjenesten ved lansering
Om Norske Tidende
Hva betyr A1, B, B1, C osv? info
Kapitler uten data er fjernet. Melding opprettet: 24.04.2025 07:01:03