Viktig informasjon i saken hentes i sanntid direkte fra EPO sitt register (European Patent Register), slik at du enkelt og raskt får oversikt i saken.
Beskrivelse Verdi
Saken / databasen er sist oppdatert info  
Tittel METHODS OF LOWERING THE ERROR RATE OF MASSIVELY PARALLEL DNA SEQUENCING USING DUPLEX CONSENSUS SEQUENCING
Status
Hovedstatus
Detaljstatus
I kraft info EP patent gjort gjeldende i Norge EP patent besluttet gjeldende i Norge
Patentnummer NO/EP2828218
Europeisk (EP) publiserings nummer EP2828218
EP levert
EP søknadsnummer 13764186.6
EP meddelt
Prioritet 2012.03.20, US 201261613413 P, .... se mer/flere nedenfor
Sakstype Europeisk
Løpedag
Utløpsdato
Allment tilgjengelig
Validert i Norge
Innehaver University of Washington through its Center for Commercialization (US)
Oppfinner SCHMITT, Michael (US) .... se mer/flere nedenfor
Fullmektig Valet Patent Services, LLP (DE)
Lenke til European patent Register Informasjon i saken, dokumenter og patentfamilie
Patentfamilie Se i Espacenet

EPO translation logo


Se forsidefigur og sammendrag i Espacenet

T3

Beskrivelse

Krav

Patentkrav1. Framgangsmåte for generering av en feilkorrigert sekvens av et dobbelttrådet målnukleinsyremolekyl som omfatter individuell merking av hver av de to trådene i det dobbelttrådede mål-nukleinsyremolekylet ved ligasjon av begge trådene i det dobbelttrådede målnukleinsyremolekylet til minst ett enkelt molekylidentifikator-(SMI)-adaptor-molekyl som omfatter en SMI-sekvens for å danne et SMI-mål-nukleinsyrekompleks, hvori SMI-sekvensen omfatter minst én utarmet eller halv-utarmet nukleinsyresekvens, slik at SMI-mål-nukleinsyrekomplekset omfatter en unik identifikator;uavhengig amplifisering av hver streng i SMI-mål-nukleinsyrekomplekset, som resulterer i at hver streng danner et distinkt enda relatert sett med amplifiserte SMI-mål-nukleinsyreprodukter; sekvensering av de forsterkede SMI-mål-nukleinsyreproduktene som omfatter den unike identifikatoren;sammenlikning av sekvensene av de amplifiserte SMI-mål-nukleinsyreproduktene framskaffet fra én streng av den dobbelttrådede mål-nukleinsyren med sekvensene av de amplifiserte SMI-målnukleinsyreproduktene framskaffet fra den andre strengen ved den dobbelttrådede målnukleinsyren, slik at en mutasjon som kun opptrer ved en spesifikk posisjon i én eller flere sekvenser fra én av trådene identifiseres som en feil som introduseres under amplifisering eller sekvensering.2. Framgangsmåte ifølge krav 1, hvori det dobbelttrådede mål-nukleinsyremolekylet er et dobbelttrådet DNA-molekyl eller RNA-molekyl.3. Framgangsmåte ifølge ett av kravene 1 til 2, omfatter videre generering av en feilkorrigert dobbelttrådet konsensus-sekvens ved (i) gruppering av de sekvensierte SMI-målnukleinsyreproduktene inn i familier med parede mål-nukleinsyretråder basert på et felles sett med SMI-sekvenser; og (ii) fjerne parede mål-nukleinsyrestrengsekvenser som oppviser én eller flere nukleotidposisjoner hvor de parede mål-nukleinsyretrådene er i uoverenstemmelse, eller alternativt fjerne nukleotidposisjoner fra nukleinsyrestrengsekvenser hvor de parede trådene er i uoverenstemmelse ved den spesifikke posisjonen.4. Framgangsmåte ifølge ett av kravene 1 til 3, hvori det dobbelttrådede mål-nukleinsyremolekylet er et klippet dobbelttrådet DNA eller RNA fragment.5. Framgangsmåte ifølge ett av kravene 1 til 4, hvori det dobbelttrådede SMI-målnukleinsyrekomplekset i tillegg omfatter minst to PCR-primer-bindingsseter, minst to sekvenserings-primerbindingsseter, en dobbelttrådet fiksert referansesekvens eller en kombinasjon av samme. 6. Framgangsmåte ifølge ett av kravene 1 til 5, hvori det dobbelttrådede SMI-målnukleinsyrekomplekset omfatter en enkelttrådet SMI-sekvens, og fortrinnsvis hvori den utarmede eller halvutarmede nukleinsyresekvensen omfatter en første nukleotid-n-mer-sekvens.7. Framgangsmåte ifølge ett av kravene 1 til 6, hvori det dobbelttrådede SMI-målnukleinsyrekomplekset omfatter en SMI-sekvens i hver av dets tråder, og fortrinnsvis hvori SMI-sekvensen omfatter (i) en første utarmet eller halv-utarmet sekvens og (ii) en andre utarmet eller halv-utarmet sekvens som er komplementær med den første slike sekvensen.8. Framgangsmåte ifølge ett av kravene 1 til 7, hvori SMI-sekvensen er generert fra et bibliotek med individuelle oligonukleotider med kjent sekvens.9. Framgangsmåte ifølge ett av kravene 1 til 8, hvori den utarmede eller halv-utarmede nukleinsyresekvensen omfatter en første nukleotid-n-mer-sekvens med nukleotidlengde mellom omtrent 3 og 20.10. Framgangsmåte ifølge ett av kravene 1 til 9, hvori SMI-adaptor-molekylet omfatter en Y-form, en U-form eller en kombinasjon av samme.11. Framgangsmåte ifølge ett av kravene 1-10, hvori det dobbelttrådede SMI-målnukleinsyrekomplekset omfatter et SMI-adaptor-molekyl ved hver ende.12. Framgangsmåte ifølge ett av kravene 1 til 11, hvori hver streng i SMI-målnukleinsyre-komplekset er forsterket ved PCR.13. Framgangsmåte ifølge ett av kravene 1 til 12, hvori SMI-målnukleinsyre-komplekset inkluderer minst to forskjellige PCR-primer- eller strømcellebindingsseter; og hvori valgfritt SMI-målnukleinsyrekomplekset i tillegg inkluderer minst to forskjellige sekvenserings-primerbindingsseter.14. Framgangsmåte ifølge krav 13, hvori det dobbelttrådede SMI-mål-nukleinsyre-komplekset omfatter et SMI-adaptor-molekyl ved hver ende, og hvori minst ett av SMI-adaptor-molekylene omfatter en Y-form.
Hva betyr A1, B, B1, C osv? info
Innehaver i EP:
University of Washington through its Center for Commercialization
4311 11th Avenue NE Suite 500 Seattle, WA 98105-4608 US
c/o University of Washingtonthrough its center for commercialization4311 11th Avenue NE, Suite 500 Seattle, WA 98105-4608 US
c/o University of Washingtonthrough its center for commercialization4311 11th Avenue NE, Suite 500 Seattle, WA 98105-4608 US
c/o University of Washingtonthrough its center for commercialization4311 11th Avenue NE, Suite 500 Seattle, Washington 98105-4608 US
Fullmektig i Norge:
Valet Patent Services, LLP
Siedlungsstrasse 4 A 85253 ERDWEG DE
Din referanse: V-2020-576
Fullmektig i EP:
HGF
1 City Walk Leeds LS11 9DX GB

2012.03.20, US 201261613413 P

2012.04.17, US 201261625319 P

2012.04.17, US 201261625623 P

CHRISSY H ROBERTS ET AL: "Short template amplicon and multiplex megaprimer-enabled relay (STAMMER) sequencing, a simultaneous approach to higher throughput sequence-based typing of polymorphic genes", IMMUNOGENETICS, SPRINGER, BERLIN, DE, vol. 62, no. 4, 4 March 2010 (2010-03-04), pages 253-260, XP019799828, ISSN: 1432-1211 (B1)

K. SHIROGUCHI ET AL: "Digital RNA sequencing minimizes sequence-dependent bias and amplification noise with optimized single-molecule barcodes", PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES, vol. 109, no. 4, 9 January 2012 (2012-01-09), pages 1347-1352, XP055037481, ISSN: 0027-8424, DOI: 10.1073/pnas.1118018109 (B1)

TEEMU KIVIOJA ET AL: "Counting absolute numbers of molecules using unique molecular identifiers", NATURE METHODS, NATURE PUBLISHING GROUP, GB, vol. 9, no. 1, 1 January 2012 (2012-01-01) , pages 72-74, XP002722751, ISSN: 1548-7105, DOI: 10.1038/NMETH.1778 [retrieved on 2011-11-20] (B1)

WO-A2-2006/113422 (B1)

US-A1- 2009 298 075 (B1)

US-A1- 2011 301 042 (B1)

WIEMANN S ET AL: "SIMULTANEOUS ON-LINE DNA SEQUENCING ON BOTH STRANDS WITH TWO FLUORESCENT DYES", ANALYTICAL BIOCHEMISTRY, ELSEVIER, AMSTERDAM, NL, vol. 224, no. 1, 1 January 1995 (1995-01-01), pages 117-121, XP000486746, ISSN: 0003-2697, DOI: 10.1006/ABIO.1995.1015 (B1)

US-A1- 2008 167 195 (B1)

Statushistorie

Liste over statusendringer i sakshistorikk
Hovedstatus Beslutningsdato, detaljstatus
EP patent gjort gjeldende i Norge EP patent besluttet gjeldende i Norge
EP under behandling Forespørsel om å gjøre EP patent gyldig er mottatt

Korrespondanse

Liste over sakshistorikk og korrespondanse
Dato Type korrespondanse Journal beskrivelse
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
21-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
20-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
19-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
18-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
17-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
16-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
15-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
14-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
13-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
12-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
11-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
10-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
09-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
08-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
07-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
06-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
05-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO
Utgående EP Varsel om betaling av første årsavgift (3319) (PTEP2828218)
04-01 Via Altinn-sending EP Varsel om betaling av første årsavgift (3319) (PTEP2828218)
Utgående EP Registreringsbrev (3210) (PTEP2828218)
03-01 Brev UT EP Registreringsbrev (3210) (PTEP2828218)
Innkommende Søknadsskjema Patent
01-01 Søknadsskjema Patent Søknadsskjema Patent
01-02 EP oversettelse EP-2828218_Claims_Norwegian
01-03 Hovedbrev NO form_
01-04 Fullmakt POA-Norway signed
Innkommende EP Publiseringsdokument fra EPO
02-01 EP Publiseringsdokument fra EPO EP Publiseringsdokument fra EPO

Til betaling:

Neste fornyelse/årsavgift:

Betalingshistorikk:

Liste av betalinger
Beskrivelse / Fakturanummer Betalingsdato Beløp Betaler Status
Årsavgift 13. avg. år (EP) 2025.03.12 5460 CPA GLOBAL LIMITED Betalt og godkjent
Årsavgift 12. avg. år (EP) 2024.02.22 3850 CPA GLOBAL LIMITED Betalt og godkjent
Årsavgift 11. avg. år (EP) 2023.03.09 3500 CPA GLOBAL LIMITED Betalt og godkjent
Årsavgift 10. avg. år (EP) 2022.03.09 3200 CPA GLOBAL LIMITED Betalt og godkjent
Årsavgift 9. avg. år (EP) 2021.03.09 2850 CPA GLOBAL LIMITED Betalt og godkjent
32016696 expand_more 2020.12.07 5500 Valet Patent Services, LLP Betalt
Denne oversikten kan mangle informasjon, spesielt for eldre saker, om tilbakebetaling, internasjonale varemerker og internasjonale design.

Lenker til publikasjoner og Norsk Patenttidende (søkbare tekstdokumenter)

Allment tilgjengelig patentsøknad
Hva betyr A1, B, B1, C osv? info
Kapitler uten data er fjernet. Melding opprettet: 26.04.2025 00:55:37